Barrapunto

Analisis y desarrollo no es I+D. Generalmente las tareas de análisis y diseño llevan aparejadas unos documentos que son los que se entregan.
También es cierto que generalmente las fuentes entran dentro del contrato, pero también es cierto que el precio es distinto y las garantías varían (si no entregas las fuentes la garantía debe ser mayor. Si las entregas pueden ser menores o incluso inexistentes).

Pues no sé cómo:

Investigación
Desarrollo
Innovación

I+D+I

El análisis y diseño de una aplicación no es I+D, lo sería si tubieses que desarrollar un nuevo algoritmo para realizar un tarea para la que nadie antes lo ha hecho. Sino, no es mas que la aplicación de metodologias preexistentes para la obtención de un resultado.
Yo personalmente no considero que el analisis y diseño sea I+D, ya te digo, no estan inventando nada NUEVO.

Puede serlo y puede no serlo. Si una academia te encarga un programa para gestionar las matrículas y les montas un mínimo frontend a una base de datos con cuatro cosas más, ¿de verdad consideras que estás haciendo I+D? ¿registrando SQL quizás? ;-)