La verdad es que estaría muy bien que fueras desarrallondo aunque fuera someramente cada uno de los epígrafes en sucesivas entradas de tu bitácora, aunque comprendo que es darte curro cuando tienes que centrarte más en otras cosas
A mi me ha llamado la atención lo de los Ciliates, me ha recordado algo de un método de correción de pesos en redes neuronales mediante algoritmos genéticos...pero vamos yo soy que hablo de oidas
La computación con ADN, ¿es algo asi como trabajar directamente con algoritmos genéticos (donde defines operaciones de cruce y tal), pero realmente trabajando con material genético? Si es así, entre todo el material genético final (supongo que hablamos de cantidades de cadenas de adn acojonantes) ¿como se selecciona la mejor solucion?
La computación con ADN, ¿es algo asi como trabajar directamente con algoritmos genéticos (donde defines operaciones de cruce y tal), pero realmente trabajando con material genético?
El experimento original de Adleman si; luego se han desarrollado otros modelos que no.
Si es así, entre todo el material genético final (supongo que hablamos de cantidades de cadenas de adn acojonantes) ¿como se selecciona la mejor solucion?
No se selecciona "la mejor solucion", se seleccionan "todas las soluciones que cumplan las restricciones". Se van filtrando cadenas de ADN por diferentes metodos quimicos. Por ejemplo, para separar las cadenas segun su longitud se utiliza la electroforesis en gel [www2.uah.es].
El experimento de Adleman tenia dos pasos:
Generar todas las cadenas de ADN posibles
Eliminar las cadenas que no cumplan ciertas restricciones
Las cadena(s) que no se eliminan representan la solucion (o soluciones) al problema.
--
En España la mejor manera de guardar un secreto es escribir un libro.
- Cuando modelas las operaciones, luego eso se puede ejecutar? es decir suponiendo X cortar la cadena AC(su formula matematica asociada), tu podrias ejecutar esa ruptura?. Como le envias X al organismo?. O solo son estudios teoricos?.
- Cuando dices que son paralelos es porque la propia filosofia del adn que se autoreplica y que tiene sus encimas encargadas de partir los conjuntos de bases nitrogenadas y unirlas, funcionan en paralalelo, no?. Existe una manera de hacer que sea secuencial?. Si quieres que una cosa vaya detras de la otra por ejemplo i++, imprime i, que es lo que tendrias que hacer?. Existe algun metodo de paralelizacion para provocar la secuencializacion(uno detras de otro)?
- Suena muy interesante todo esto. Pasanos enlaces y si tan en castellano mejor que mejor, ademas apoyo la mocion de fronter que dice que desarrolles poco a poco cada dia uno de los distintos campos en la medida de las posiblidades.
Cuando modelas las operaciones, luego eso se puede ejecutar? es decir suponiendo X cortar la cadena AC(su formula matematica asociada), tu podrias ejecutar esa ruptura?.
Si, claro que se puede ejecutar. Estamos modelando operaciones que los bioquimicos llevan 30 anhos haciendo todos los dias; lo que pasa es que los bioquimicos de algoritmica no tienen mucha idea y hasta que no llego Adleman y dijo "Que con esto se puede computar!!!!" nadie habia caido en la cuenta.
Un poco (pero poco) de bioquimica: una enzima es una "maquina" que va leyendo cadenas de ADN. Cuando encuentra una cierta secuencia, hace algo.
En la naturaleza hay multitud de enzimas, y si lo necesitas te puedes disenhar tus propias enzimas (con ciertos limites).
Enzimas famosas:
Transcriptasa: Lee cualquier cadena de ADN y la traduce a ARN.
Transcriptasa inversa: Lee cualquier cadena de ARN y la traduce a ADN.
E.Coli: Lee ADN y cuando encuentra cierta secuencia, corta la cadena.
Como le envias X al organismo?. O solo son estudios teoricos?.
Hum... hasta ahora la computacion con ADN (dejo a los ciliates fuera) se esta haciendo en tubos de ensayo o en microfluidos. Un "chip" microfluidico es un "sitio" con microcamaras llenas (o vacias) de compuestos bioquimicos en disolucion y microcanales que conectan las microcamaras entre si. Hay "grifos" que te permiten abrir y cerrar los microcanales para conectar/aislar las microcamaras.
- Cuando dices que son paralelos es porque la propia filosofia del adn que se autoreplica y que tiene sus encimas encargadas de partir los conjuntos de bases nitrogenadas y unirlas, funcionan en paralalelo, no?
Mas o menos. Si yo tengo un tubo de ensayo con 10^15 cadenas de ADN y aplico el operador "cortar" (que se implementa con la enzima E.Coli) lo aplico sobre las 10^15 cadenas a la vez.
Existe una manera de hacer que sea secuencial?. Si quieres que una cosa vaya detras de la otra por ejemplo i++, imprime i, que es lo que tendrias que hacer?
Si, claro. Cada reaccion bioquimica ocurre bajo ciertas condiciones (temperatura, Ph, etc.) Si quieres cosas secuenciales debes:
Colocar la disolucion en las condiciones requeridas para que se de la reaccion X.
Esperar un poco.
Colocar la disolucion en las condiciones requeridas para que se de la reaccion Y.
Pasanos enlaces y si tan en castellano mejor que mejor
En castellano poco. Y enlaces dificil, porque los articulos son de pago. Mira aqui [aol.com] y sobretodo aqui [google.com].
--
En España la mejor manera de guardar un secreto es escribir un libro.
Así que finalmente no tengo ni idea de computación. No tenía ni idea de que se estuvieran haciendo estas cosas, aparte de la informática cuántica.
Muy interesante tu post.
Comentas que hasta donde tu sabes la computacion cuantica es puramente teorica.
Bien, hace como año y medio vino invitado un investigador de la universidad de Sevilla a darnos una charla para una clase de seguridad, en la que nos iba a hablar de la criptografia cuantica, y para introducirnos en el tema nos hablo de la computacion cuantica. Lo que mas nos impresiono a toda la clase fue que dijo que ya se habia conseguido en laboratorio juntar 5 bits cuanticos y que funciono. Siento no poder decirte el nombre de aquel hombre.
... los algoritmos bioinspirados no basados en el modelo genetico en tu lista?
Que pueden incluir por ejemplo, entre otros, aquellos basados en colonias de hormigas, los derivados del self-repairing, self-replicating (tuve la suerte de estar con gente que desarrollaba el biowall [lslwww.epfl.ch]) o basados en la teoria de minima energia del enfriamiento de las estructuras ceramicas.
PD Hace tiempo que deje de intentar de entender todas las formas de computacón, demasiado para mi. Solo conseguia preguntas sin respuestas y grandes dolores de cabeza.
Re:Incluirias...
de McPolu
(Puntos:2)
Viernes, 26 Agosto de 2005, 14:25h
Re:Incluirias...
de Robert h Quinn
(Puntos:2)
Viernes, 26 Agosto de 2005, 19:01h
Re:Incluirias...
de McPolu
(Puntos:2)
Viernes, 26 Agosto de 2005, 19:23h
muy interesante
(Puntos:2)( http://barrapunto.com/ | Última bitácora: Lunes, 24 Febrero de 2014, 10:03h )
podrias poner algunos links por donde empezar?
Dale fuego a un hombre y estara caliente un dia, prendele fuego y estara caliente el resto de su vida.
Muy interesante
(Puntos:1)( http://barrapunto.com/ | Última bitácora: Viernes, 14 Julio de 2006, 00:21h )
La verdad es que estaría muy bien que fueras desarrallondo aunque fuera someramente cada uno de los epígrafes en sucesivas entradas de tu bitácora, aunque comprendo que es darte curro cuando tienes que centrarte más en otras cosas
A mi me ha llamado la atención lo de los Ciliates, me ha recordado algo de un método de correción de pesos en redes neuronales mediante algoritmos genéticos...pero vamos yo soy que hablo de oidas
adelante-adelante-abajo-abajo-puñetazo alto [barrapunto.com]
pregunta
(Puntos:2)( http://zerjio.com/ | Última bitácora: Martes, 30 Enero de 2007, 17:23h )
La computación con ADN, ¿es algo asi como trabajar directamente con algoritmos genéticos (donde defines operaciones de cruce y tal), pero realmente trabajando con material genético? Si es así, entre todo el material genético final (supongo que hablamos de cantidades de cadenas de adn acojonantes) ¿como se selecciona la mejor solucion?
Muchas gracias por adelantado
Zerjillo
Re:pregunta
(Puntos:4, Interesante)( http://mcpolu.blogspot.com/ | Última bitácora: Miércoles, 05 Marzo de 2014, 00:04h )
La computación con ADN, ¿es algo asi como trabajar directamente con algoritmos genéticos (donde defines operaciones de cruce y tal), pero realmente trabajando con material genético?
El experimento original de Adleman si; luego se han desarrollado otros modelos que no.
Si es así, entre todo el material genético final (supongo que hablamos de cantidades de cadenas de adn acojonantes) ¿como se selecciona la mejor solucion?
No se selecciona "la mejor solucion", se seleccionan "todas las soluciones que cumplan las restricciones". Se van filtrando cadenas de ADN por diferentes metodos quimicos. Por ejemplo, para separar las cadenas segun su longitud se utiliza la electroforesis en gel [www2.uah.es].
El experimento de Adleman tenia dos pasos:
- Generar todas las cadenas de ADN posibles
- Eliminar las cadenas que no cumplan ciertas restricciones
Las cadena(s) que no se eliminan representan la solucion (o soluciones) al problema.En España la mejor manera de guardar un secreto es escribir un libro.
Joder que articulo mas interesante!
(Puntos:1)( Última bitácora: Jueves, 19 Junio de 2008, 15:49h )
Hablanos sobre la computación con ADN.
- Cuando modelas las operaciones, luego eso se puede ejecutar? es decir suponiendo X cortar la cadena AC(su formula matematica asociada), tu podrias ejecutar esa ruptura?. Como le envias X al organismo?. O solo son estudios teoricos?.
- Cuando dices que son paralelos es porque la propia filosofia del adn que se autoreplica y que tiene sus encimas encargadas de partir los conjuntos de bases nitrogenadas y unirlas, funcionan en paralalelo, no?. Existe una manera de hacer que sea secuencial?. Si quieres que una cosa vaya detras de la otra por ejemplo i++, imprime i, que es lo que tendrias que hacer?. Existe algun metodo de paralelizacion para provocar la secuencializacion(uno detras de otro)?
- Suena muy interesante todo esto. Pasanos enlaces y si tan en castellano mejor que mejor, ademas apoyo la mocion de fronter que dice que desarrolles poco a poco cada dia uno de los distintos campos en la medida de las posiblidades.
Muchas gracias
La unión hace la fuerza... Rompamos su unión.
Re:Joder que articulo mas interesante!
(Puntos:4, Informativo)( http://mcpolu.blogspot.com/ | Última bitácora: Miércoles, 05 Marzo de 2014, 00:04h )
Cuando modelas las operaciones, luego eso se puede ejecutar? es decir suponiendo X cortar la cadena AC(su formula matematica asociada), tu podrias ejecutar esa ruptura?.
Si, claro que se puede ejecutar. Estamos modelando operaciones que los bioquimicos llevan 30 anhos haciendo todos los dias; lo que pasa es que los bioquimicos de algoritmica no tienen mucha idea y hasta que no llego Adleman y dijo "Que con esto se puede computar!!!!" nadie habia caido en la cuenta.
Un poco (pero poco) de bioquimica: una enzima es una "maquina" que va leyendo cadenas de ADN. Cuando encuentra una cierta secuencia, hace algo.
En la naturaleza hay multitud de enzimas, y si lo necesitas te puedes disenhar tus propias enzimas (con ciertos limites).
Enzimas famosas:
Como le envias X al organismo?. O solo son estudios teoricos?.
Hum... hasta ahora la computacion con ADN (dejo a los ciliates fuera) se esta haciendo en tubos de ensayo o en microfluidos. Un "chip" microfluidico es un "sitio" con microcamaras llenas (o vacias) de compuestos bioquimicos en disolucion y microcanales que conectan las microcamaras entre si. Hay "grifos" que te permiten abrir y cerrar los microcanales para conectar/aislar las microcamaras.
- Cuando dices que son paralelos es porque la propia filosofia del adn que se autoreplica y que tiene sus encimas encargadas de partir los conjuntos de bases nitrogenadas y unirlas, funcionan en paralalelo, no?
Mas o menos. Si yo tengo un tubo de ensayo con 10^15 cadenas de ADN y aplico el operador "cortar" (que se implementa con la enzima E.Coli) lo aplico sobre las 10^15 cadenas a la vez.
Existe una manera de hacer que sea secuencial?. Si quieres que una cosa vaya detras de la otra por ejemplo i++, imprime i, que es lo que tendrias que hacer?
Si, claro. Cada reaccion bioquimica ocurre bajo ciertas condiciones (temperatura, Ph, etc.) Si quieres cosas secuenciales debes:
Pasanos enlaces y si tan en castellano mejor que mejor
En castellano poco. Y enlaces dificil, porque los articulos son de pago. Mira aqui [aol.com] y sobretodo aqui [google.com].
En España la mejor manera de guardar un secreto es escribir un libro.
La leche
(Puntos:1)( http://barrapunto.com/ )
El torero jedi. Usa la Fuerza y el capote [bitacoras.com]
Computacion cuantica
(Puntos:1)( http://www.firmasonline.com/1firmas/camp1.asp?C=1353 )
Comentas que hasta donde tu sabes la computacion cuantica es puramente teorica.
Bien, hace como año y medio vino invitado un investigador de la universidad de Sevilla a darnos una charla para una clase de seguridad, en la que nos iba a hablar de la criptografia cuantica, y para introducirnos en el tema nos hablo de la computacion cuantica. Lo que mas nos impresiono a toda la clase fue que dijo que ya se habia conseguido en laboratorio juntar 5 bits cuanticos y que funciono. Siento no poder decirte el nombre de aquel hombre.
Espero que te sirva de algo.
Saludos a todos.
Incluirias...
(Puntos:2)( Última bitácora: Miércoles, 28 Diciembre de 2011, 00:46h )
Que pueden incluir por ejemplo, entre otros, aquellos basados en colonias de hormigas, los derivados del self-repairing, self-replicating (tuve la suerte de estar con gente que desarrollaba el biowall [lslwww.epfl.ch]) o basados en la teoria de minima energia del enfriamiento de las estructuras ceramicas.
PD Hace tiempo que deje de intentar de entender todas las formas de computacón, demasiado para mi. Solo conseguia preguntas sin respuestas y grandes dolores de cabeza.
Re:Talibán ortográtifico
(Puntos:2)( http://aimak.com/ | Última bitácora: Martes, 19 Septiembre de 2006, 08:37h )
--
Karma Derrochator [20050402]
Re:Talibán ortográtifico
(Puntos:1)( http://barrapunto.com/ | Última bitácora: Lunes, 17 Mayo de 2010, 16:58h )
"I may be a pretty sad person, but I don't make jokes in base 13."