Barrapunto

Si un usuario novato quiere hacer tal cosa no va a encontrar tu proyecto. Vía Google encontrará mucho antes a alguien que explicó que con un "find ... -exec ..." se puede hacer (hay descompresores que no permiten que les metas mas de un archivo como parámetro, así que hay que usar "find"), y simplemente hará copy&paste. En realidad, si no estamos hablando de 500 archivos, es posible que acabe antes descomprimiendolos uno a uno que intentando encontrar un proyecto como el tuyo.
Para añadir esta funcionalidad de forma que algún usuario realmente la vaya a usar... envía un parche a los compresores habituales (Ark, FileRoller) para que el usuario novato se lo encuentre delantes de los morros.

un proyecto de software libre que lo unico que hace es usar el winrar con determinadas opciones concretas para que sea mas simple usarlo...

y dices...

"La versión actual es la .25, de momento me encuentro trabajando en la versión .30. Por el momento no hay ninguna de las flags implementadas y solo descomprime rars."

en las versiones posteriores vas a meter las opciones que estás tratando evitar? pues nada muy util :)