Barrapunto

Mayus+Supr (Shift+Del) en Gnome borra directamente.

Tampoco hay necesidad de vaciar toda la papelera para borrar algo como se decía por ahí arriba, se puede borrar cualquier elemento particular de la misma (ni idea en Mac cómo es).

Agrego otra cosa: si no te gustan los atajos de teclado, en cualquier ventana de nautilus:

Editar -> Preferencias -> Comportamiento, marcar "Incluir una orden Borrar que no utilice la Papelera"

En Gnome, si sacas el pendrive correctamente (es decir lo desmontas antes de quitarlo fisicamente) y tiene archivos en su papelera de reclicaje te pregunta si quieres vaciarla.

Pues cuando desmontas el volumen te da la opción de borrar los archivos almacenados en la papelera. De todas formas puedes entrar en la papelera y borrar solo los que te interesen. Y como dicen por ahí arriba existe la posibilidad de borrar directamente un archivo.