Barrapunto

Lo lógico es aislar la parte dependiente del sistema operativo, porque esa parte es de bajo nivel.

De esa forma, migrar el grueso del programa, suele ser sencillo.

Los programadores de windows no suelen hacer eso porque para ellos no existe otra cosa.

También se pueden utilizar librerías multiplataforma.

En dispositivos "pequeños", con pantallas muy pequeñas o recursos muy limitados, sí hay un problema de portabilidad

El caso que comentas, es complejo por ese cambio de arquitectura gorda a pequeñaja

Pero aún así, en ese caso el problema no es la migración de la lógica (si la hubiera) del programa, sino del tamaño de la pantalla y acceso al SO

Un programa no trivial podrá portar la parte fundamental de lógica sin cambios

Con Qt o GTK+ hacer programas portables (incluso con la parte gráfica) es normal.